如何解决定时器产生PWM波形断续的情况？

   我用tiM3产生一个高电平幅度恒定(200us)，而频率可调的PWM波形的时候发现从示波器读取到的波形出现2~3s的低电平(正常应该是一直连续的方波)，详细情况如下：
1.TIM3定义100us中断
Timer3_Init(7200,0);
2.TIM3初始化如下：
void Timer3_Init(u16 arr,u16 psc)
{
RCC->APB1ENR|=1<<1;//TIM3时钟使能   
  TIM3->ARR=arr;  //设定计数器自动重装值//刚好1ms   
TIM3->SC=psc;  //预分频器7200,得到10Khz的计数时钟
TIM3->DIER|=1<<0;   //允许更新中断   
TIM3->DIER|=1<<6;   //允许触发中断
TIM3->CR1|=0x01;    //使能定时器3

    #ifdef PA7_OUT_PWM
        RCC->APB2ENR|=1<<2;    //使能PORTA时钟      
        GPIOA->CRL&=0x0FFFFFFF;
        GPIOA->CRL|=0x30000000;   //PA7 推挽输出     
        GPIOA->ODR|=0<<7;          //PA7 输出高   
    #endif   

   MY_NVIC_Init(1,3,TIM3_IRQChannel,2);//抢占1，子优先级3，组2
}
3.TIM3_IRQHandler中断服务函数如下，这里我发现当(timer_pwm >= 20)的值较小的时候输出的PWM波是正常的，但是当该值较小时则有问题，每次进来取反也是OK的，请问这是什么原因呢？
void TIM3_IRQHandler(void)
{

    if(TIM3->SR&0x0001)// for 1 ms
    {
   
  timer_pwm++;

  if((pwm_flag!= 0)&&(timer_pwm == 2))//持续200us的高电平
  {
      //printf("timer_pwm:%dn",timer_pwm);
      pwm_flag = 0;
            PWM_PA7_OUT = 0;
  }
  
  if(timer_pwm >= 20)//50
  {
      //printf("timer2_timer:%dn",timer2_timer);
      timer_pwm = 0;
      pwm_flag = 1;
            PWM_PA7_OUT = 1;
  }
    }

    TIM3->SR&=~(1<<0);//清除中断标志位      
}