STM32F407PWM输出时中断函数处理函数过慢，一次中断未执行完，下一次中断就进入，导致PWM波形输出紊乱

我在做毕设，使用的是STM32F407PWM输出功能，已有内含117个元素的数组前4个元素分别为1，2，1，3，后113个元素为0和1。
预期效果：根据117个数组元素，生成频率为1MHz、50%占空比、输出极性可调的117个连续方波（其中，根据前四个元素生成的方波频率不是1us）。依次读取数组元素，若数组中元素为1，则先是500ns低电平后是500ns高电平输出；若数组中元素为0，则先是500ns高电平后是500ns低电平输出，从而连续输出117个方波。
现在我遇到的问题是中断处理函数运行过慢，一次中断未执行完，下一次中断就进入，导致PWM波形输出紊乱。我用示波器测试，如果方波频率为1KHz,波形不错乱，大于10KHz,错乱现象逐渐严重。
现在我的中断处理函数运行时间大概在1us左右，因此对于1MHz的PWM输出是有问题的。所以向各位STM32的前辈请教一下，这种情况该怎样解决呀。请大家帮忙看一下。万分感谢

这是我现在的中断处理函数：

//tiM12中断服务函数

int j=0;

void TIM8_BRK_TIM12_IRQHandler(void)
{

    int t;
    extern int8_t ADSB[117];
   
    if(TIM_GetITStatus(TIM12,TIM_IT_Update)==SET) //溢出中断
            {            
                if(j==117)
                {
                    TIM_Cmd(TIM12, DISABLE);
                    TIM_ForcedOC1Config(TIM12, TIM_ForcedAction_Active);
                    j=0;
                    DS4=!DS4;
                    delay_ms(200);
                    TIM12_PWM_Init(84-1,1-1);// PWM~1MHz
                    TIM_SetCompare1(TIM12,42);     
                }
                else
                {   
                        t=ADSB[j];
                        if(t==0)
                            {
                                TIM12->CCER|=(uint16_t)0x0002;  //TIM_OCPolarity_Low
                                TIM12->ARR =84;
                            }
                        else if(t==1)
                            {
                                TIM12->CCER &=~(uint16_t)0x0002;  //TIM_OCPolarity_High
                                TIM12->ARR =84;
                            }
                      else if(t==2)
                            {
                                TIM12->CCER &=~(uint16_t)0x0002;  //TIM_OCPolarity_High
                                TIM12->ARR =210;
                          }
                        else if(t==3)
                            {
                                TIM12->CCER &=~(uint16_t)0x0002;  //TIM_OCPolarity_High
                                TIM12->ARR =294;
                          }   
                }
                j++;
            }
TIM_ClearITPendingBit(TIM12,TIM_IT_Update);  //清除中断标志位

}