AD1220采集值都是对的，转换为电压和前端电压是一致的，什么原因？

看你的两个程序不同的地方是选择的参考电压不一样,
第一个程序选择REF0作为参考电压，但是你已经选择该管脚作为激励电流源的输入管脚，内部电路无法从该管脚获取所需的参考电压。
第二个程序选择芯片自带的内部参考源，不受外部电路接法的影响，可以正常获取码值。

你所说的AD值是一个负值指的是转换之后的电压还是ADC出来的码值就是负的？建议重点查看一下将码值转换成电压的关系式，因为在你的这种电路连接下，参考电压的大小是0.5*3.24 V。

当你做断开电阻检测时候，电流源出来的电流并不会流过R21,此时相当于参考电源是没有的状态，所以出现满量程的现象应该是正常的。
至于出现负值的现象，建议重新查看一下ADC读取数据的程序以及存储数据的格式是否满足要求。也可以更换一个比较大的电阻试试，看看读取码值是否是正的。

如果确定初始化没有问题的话，可以考虑以下更换芯片试试。但是建议更换不同的电阻输入观察码值是否呈现规律性变化，从而可以更好的找到原因。