请问系统中485总线上的设备有5V供电和3.3V供电设备，对总线上的数据通信会有影响吗？

你的是两线制的485总线吧，因为数据标1为AB端电压+（2-6）V，标0为AB端电压-（2-6）V，所以5V供电和3.3V供电都能满足电压供应要求，从这方面说对数据通信没有影响。
此外现在一般应用RS-485的设备都是采样隔离型的芯片来实现，所以大多数情况下可以较好保护设备来通信。