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刘军

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使用Arm服务器减少基因组学的时间和成本

1、使用Arm服务器减少基因组学的时间和成本

  我们现在可以展示三种主要aligners在Arm架构AWS Graviton3上的性能。AWS Gravaton3是AWS服务器系列中最新的基于Arm的服务器,也是AWS Gratiton2的后续型号。

  我们证明,与AWS Graviton2相比,AWS Gravaton3的性能提高了12%到31%。与目前最好的x86_64系统相比,Graviton3的绩效提高了10%和23%。与同类x86_64系统相比,此结果可节省20-30%的成本。

  应用程序和测试用例

  我们使用1000 Genomes项目中的human_g1k_v37引用和NIST档案中的NA12878引用。这些测试用例都反映在AWS

S3上,并使用以下方法获取

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原作者:David Lecomber

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