avr单片机两种烧写程序方式的区别？

最近在做一个单片机程序，有点疑问，用avrstudio烧程序接的是avrdragon，用ISPUSB是另外一个软件，这两种烧程序有什么区别？两者过程都是先写熔丝，写flash，写eeprom；我试着用ISPUSB连avrsrudio，没有选择成功，有点疑惑。