平台里面缺少工程中实际另外两个PCB文件是什么情况？

建议一直都是一个项目对应一个PCB文件（如果要做装配变量，可以用Variant功能）。包含多个PCB文件的项目发布到Digipcba工作区，受益于它的版本控制系统，你在其它电脑上检出这个项目时应该还是可以看到实际的PCB文件数量的。但在DigiPCBA工作区网页端，为了使查看者在原理图/PCB/BOM之间交互浏览关系更清晰，一个项目一个PCB文件的合规性应该更强。